Studio dell’effetto delle condizioni climatiche sull'evoluzione del genoma della pecora Sarda con un approccio di landscape genomics

Loi, Maria Lucia (a.a. 2016/2017) Studio dell’effetto delle condizioni climatiche sull'evoluzione del genoma della pecora Sarda con un approccio di landscape genomics. Tesi di Laurea in Scienze delle produzioni zootecniche (LM-86), Università degli studi di Sassari, relatore Macciotta Nicolò Pietro Paolo, pp. 44. [Tesi di Laurea magistrale]

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Abstract

Obiettivo di questo lavoro è stato quello di studiare gli effetti dell’ambiente di allevamento sul genotipo di ovini di razza Sarda. Un campione di pecore di razza Sarda è stato suddiviso in due gruppi sulla base delle temperature registrate nel periodo 1995-2014. Parallelamente alla diversa temperatura ambientale, i due gruppi si distinguevano anche per l’altitudine di localizzazione degli allevamenti, maggiore nel gruppo freddo rispetto a quello caldo. Tutti gli animali sono stati genotipizzati con il chip Infinium Ovine SNP50 v1 BeadChip; dopo il quality control sono stati utilizzati 45.947 SNPs distribuiti su tutti e 27 i cromosomi. Le differenze tra i due gruppi sono state identificate tramite l’indice di fissazione di Wright (FST), a cui sono stati applicati LOWESS e CONTROL CHART. Queste tecniche hanno permesso di identificare 623 marcatori significativi, raggruppati in 97 selection signatures, con un numero di SNP significati per cromosoma che variava da 83 (OAR1) a 5 (OAR12).

Tipologia di tesi: Tesi di Laurea magistrale
Autore: Loi, Maria Lucia
Relatore: Macciotta, Nicolò Pietro Paolo
Correlatore: Cesarani, Alberto; Sorbolini, Silvia
Disciplina MIUR: Area 07 - Scienze agrarie e veterinarie > AGR/17 ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICO
Struttura: Dipartimento di Agraria
Corsi di Laurea: Scienze delle produzioni zootecniche (LM-86)
Anno Accademico: 2016/2017
Sessione: Straordinaria
Parole Chiave: Adattamento all'ambiente, stress caldo, biodiversità
Codice ID dell'EPrint: 1068
Data di Deposito: 09 Mar 2018 09:06
Tipo di tesi: Sperimentale
URI: http://unisslaurea.uniss.it/id/eprint/1068

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